पेप्टाइड्स को अनुकूलित करें

बड़े पैमाने पर कस्टम पेप्टाइड संश्लेषण को या तो तरल समाधान में या ठोस चरण में किया जा सकता है। सामान्य तौर पर, 8 एमिनो एसिड से कम पेप्टाइड्स समाधान रसायन विज्ञान द्वारा अधिक आर्थिक रूप से तैयार किए जाते हैं। 8 अवशेषों से बड़े पेप्टाइड्स को आम तौर पर ठोस चरण रसायन विज्ञान द्वारा इकट्ठा किया जाता है। ठोस चरण पेप्टाइड संश्लेषण (एसपीपी) को मैन्युअल रूप से या पूरी तरह से स्वचालित फैशन में किया जा सकता है। लघु पेप्टाइड्स के लिए मैनुअल संश्लेषण लाभप्रद है क्योंकि यह स्केलिंग करते समय अधिक लचीलेपन के लिए अनुमति देता है और यह अधिक आसानी से अप्रत्याशित समस्याओं के समस्या निवारण की अनुमति देता है। उदाहरण के लिए, एक ऑपरेटर बिजली की विफलता या साधन विफलता की स्थिति में, डिप्रोटेक्शन के दौरान पाइपरिडीन को धो सकता है। इसके अलावा, थर्मोडायनामिक मिश्रण को एक मैनुअल दृष्टिकोण के साथ बेहतर रूप से नियंत्रित किया जा सकता है। दूसरी ओर, बड़े पैमाने पर पूरी तरह से स्वचालित पेप्टाइड संश्लेषण उपकरणों को अप्राप्य संचालन और संश्लेषण रन के व्यापक प्रलेखन का स्पष्ट लाभ होता है। इसलिए, स्वचालित पेप्टाइड संश्लेषण को आमतौर पर मध्य-पैमाने की सीमा में लंबे पेप्टाइड्स के संश्लेषण के लिए सबसे अच्छा विकल्प के रूप में चुना जाता है।

पेप्टाइड संश्लेषण प्रदाताओं को गुणवत्ता स्तर और संश्लेषित पेप्टाइड्स की अधिकतम लंबाई द्वारा मापा जाता है क्योंकि उच्च गुणवत्ता पर लंबे पेप्टाइड्स को संश्लेषित करना अधिक कठिन होता है। संश्लेषित पेप्टाइड्स को विश्लेषणात्मक एचपीएलसी और मास स्पेक्ट्रोमेट्री द्वारा एक क्यूसी प्रक्रिया से गुजरना होगा। अक्सर, अमीनो एसिड विश्लेषण और अनुक्रमण की भी आवश्यकता होती है।

जैविक रूप से सक्रिय पेप्टाइड्स को सक्रिय फार्मास्युटिकल अवयवों (एपीआई) के साथ -साथ वासोप्रेसिन, गोनाडोरेलिन, लेउप्रोलाइड और गोसेरेलिन जैसे स्टैंडअलोन उत्पादों की बढ़ती संख्या में एकीकृत किया गया है। मानव जीनोम परियोजना के पूरा होने के परिणामस्वरूप लगभग 30, 000 मानव जीनोम में एन्कोडेड प्रोटीन की पहचान हुई और बायोमेडिकल शोधकर्ताओं को तलाशने के लिए कई और नए लक्ष्य अणु प्रदान किए गए। तर्कसंगत डिजाइन दृष्टिकोण का उपयोग करके किसी दिए गए पेप्टाइड या प्रोटीन की देशी पोटेंसी को बढ़ाने की संभावना की जांच करने के लिए, छोटे और बड़ी मात्रा में पेप्टाइड्स की आवश्यकता होती है, कुछ को मिलीग्राम पैमाने में। एक बार एक वांछित गतिविधि या शक्ति की पहचान हो जाने के बाद, बड़े पैमाने पर संश्लेषण की आवश्यकता होती है। इसके लिए, छोटे पशु अध्ययन शुरू करने के लिए ग्राम से मल्टी-ग्राम स्केल की आवश्यकता हो सकती है। अक्सर, सफल सत्यापन के बाद, संश्लेषण के एक बड़े पैमाने पर वांछित हो सकता है। ये सैकड़ों ग्राम से लेकर बहु-किलो मात्रा तक पैमाने पर हो सकते हैं।

थ्रूपुट और समानांतर संश्लेषण का प्रश्न
विभिन्न अनुप्रयोगों और अनुसंधान के चरणों में पेप्टाइड्स की विभिन्न संख्याओं को संश्लेषित करने की आवश्यकता होती है। एक पेप्टाइड ड्रग डिस्कवरी कार्यक्रम में हिट खोजने के लिए पेप्टाइड्स के सैकड़ों (या यहां तक ​​कि हजारों) स्क्रीनिंग शामिल हो सकती है, इसके बाद एक एकल उम्मीदवार की पहचान करने के लिए केंद्रित पुस्तकालयों के साथ संरचना-गतिविधि संबंधों (एसएआर) का अनुकूलन किया जा सकता है जो क्लिनिक में उन्नत हो सकता है। इसलिए सफलता की कुंजी एक सिंथेसाइज़र का चयन करना है जिसमें पर्याप्त प्रतिक्रिया वाले जहाज हैं जो समानांतर संश्लेषण के स्तर को वितरित कर सकते हैं जो आपको अपने एप्लिकेशन 1 से मेल खाने की आवश्यकता है।
 

संश्लेषण मान
आरएंडडी प्रक्रिया के विभिन्न चरणों में पेप्टाइड सामग्री की विभिन्न मात्रा की भी आवश्यकता होगी। उदाहरण के लिए, पेप्टाइड थैरेप्यूटिक्स के रूप में आवश्यक मात्रा में वृद्धि के रूप में वृद्धि अनुकूलन और पूर्व-नैदानिक ​​विकास का नेतृत्व करने के लिए शुरुआती स्क्रीनिंग के माध्यम से चलती है। सही पेप्टाइड सिंथेसाइज़र पैमाने के लिए वर्तमान आवश्यकताओं को पूरा करेगा और यहां तक ​​कि स्केल अप के लिए कुछ लचीलेपन की पेशकश कर सकता है जो आवश्यकताओं को आगे बढ़ाता है।
 

अनुक्रम कठिनाई और पेप्टाइड लंबाई
पेप्टाइड्स को संश्लेषित करने से कई अनुक्रम-आधारित चुनौतियां पेश हो सकती हैं, जैसे कि कुछ अवशेष संयोजनों के कारण एकत्रीकरण या माध्यमिक संरचना गठन। इन चुनौतियों पर काबू पाने में एक पेप्टाइड सिंथेसाइज़र चुनना शामिल है जो आपको संश्लेषण को अनुकूलित करने में मदद कर सकता है। उच्चतम संभव शुद्धता की तलाश में कई मापदंडों को अनुकूलित करना शामिल है, जैसे कि प्रतिक्रिया समय, युग्मन अभिकर्मक की पसंद, सांद्रता, राल प्रकार, तापमान, और संरचना-ब्रेकिंग अवशेषों के प्लेसमेंट। मल्टी-चैनल उपकरण समानांतर में विभिन्न मापदंडों का परीक्षण करने के लिए आदर्श हैं। ट्रायल-एंड-एरर को कम करने का एक तरीका जब मुश्किल पेप्टाइड्स को संश्लेषित करता है, तो कचरे की धारा की निगरानी के बजाय वास्तविक समय के यूवी निगरानी का उपयोग होता है क्योंकि अधिकांश व्यावसायिक रूप से उपलब्ध उपकरण करते हैं। सिंथेसाइज़र जो प्रतिक्रिया समाधान की निगरानी करते हैं, जबकि यह मिश्रण हो रहा है, प्रतिक्रिया समय के इन-प्रोसेस नियंत्रण प्रदान करता है, जो उपज और पवित्रता में बहुत सुधार करता है। यदि आप लंबे पेप्टाइड्स को संश्लेषित कर रहे हैं, तो यह महत्वपूर्ण है कि प्रतिक्रिया दक्षता को हर कदम पर अधिकतम किया जाता है, क्योंकि छोटी अक्षमताएं और पक्ष प्रतिक्रियाएं नाटकीय रूप से शुद्धता और उपज को कम करने के लिए आगे बढ़ेंगी। संश्लेषण दक्षता में सुधार करने के लिए, कुछ उपकरणों में एक द्रव प्रणाली होती है जो शून्य मृत वॉल्यूम और प्रतिक्रिया चरणों के बीच कोई क्रॉस-संदूषण सुनिश्चित करती है, जो ठोस चरण पेप्टाइड संश्लेषण के परिवर्धन, विलोपन और अन्य सामान्य पक्ष प्रतिक्रियाओं को कम करती है।
 

विशेष रसायन विज्ञान की आवश्यकता
क्या आप केवल मानक रैखिक पेप्टाइड्स को संश्लेषित करेंगे, या आप चक्रीय पेप्टाइड्स, पेप्टोइड्स या अन्य पेप्टिडोमिमेटिक्स बना रहे होंगे? क्या आप PNAs, PMOS या OLIGOS के साथ काम करेंगे? चक्रीय पेप्टाइड्स के संश्लेषण में अक्सर विशेष रूप से संरक्षित अमीनो एसिड डेरिवेटिव और ऑर्थोगोनल डिप्रोटेक्शन और साइक्लाइज़ेशन के लिए प्रतिक्रिया चरणों का उपयोग शामिल होगा। पेप्टोइड्स और अन्य प्रकार के पेप्टिडोमिमेटिक्स का संश्लेषण, साथ ही साथ पीएनए, ओलिगोस और ओलिगोमिमेटिक्स सभी को अद्वितीय मोनोमर्स और अभिकर्मकों की आवश्यकता होती है। इस प्रकार के अणुओं को तैयार करना एक ऐसे उपकरण की मांग करेगा जो प्रोटोकॉल और बोतल के पदों के संदर्भ में अधिकतम लचीलापन प्रदान करता है। यही कारण है कि कुछ उपकरण एक संश्लेषण के दौरान 40 एमिनो एसिड या अन्य मोनोमर्स तक का उपयोग करते हैं, बजाय प्राकृतिक अमीनो एसिड के लिए 20 पदों तक सीमित होने के। इन विशेष रसायन विज्ञान के लिए उपयोग किए जाने वाले कई मोनोमर्स और अभिकर्मक महंगे या कीमती हो सकते हैं, इसलिए कुछ सिंथेसाइज़र किसी भी अमीनो एसिड/मोनोमर बोतल की स्थिति से प्राइम-फ्री 'सिंगल-शॉट' परिवर्धन भी प्रदान करते हैं ताकि यह सुनिश्चित हो सके कि कुछ भी बर्बाद नहीं किया गया है।